JAS memperoleh sejumlah sertifikasi dari IATA’s Safety Audit of Ground Operations (ISAGO) terkait Organization and Management (ORM), Load Control (LOD), Passenger and Baggage Handling (PAB), Aircraft Handling and Loading (HDL), Aircraft Ground Movement (AGM), dan Cargo and Mail Handling (CGM) di CGK, KNO, SUB, dan DPS.
Sebagai informasi, ISAGO merupakan sistem yang diakui secara internasional untuk menilai manajemen operasional dan sistem kontrol dari suatu organisasi yang menyediakan sistem ground handling untuk maskapai penerbangan.